Refus de congé longue maladie

Bonjour, travaillant en milieu hospitalier, je suis en arrêt maladie depuis le mois de Novembre 2011 pour des problèmes de dos. Au mois de Janvier, mon employeur m'envoie un dossier de congé longue maladie à remplir. Au mois de Mars 2012, je suis convoqué par le médecin du comité médical. Suite à ce rendez-vous,"le médecin me signale qu'il ne peut me mettre qu'en mi-temps thérapeuthique ou reprise" car dans mon dossier, une pièce jointe était présente et il n'y avait que ces deux alternatives. Comment en ayant fait une demande de congé longue maladie (suggéré par mon employeur) et en ayant consulté aucun médecin, je n'ai que le choix d'être à mi-temps thérapeutique ou bien reprendre mon travail a plein temps alors que le médecin du comité médical me dit que "si ils avaient inclus le congé longue maladie il me l'aurait attribué"? PS: Le médecin conseil m'a attribué 6 mois de mi-temps thérapeutique Merci de me réponde. Bonne journée.